The Legend of Zelda: Spirit Tracks sitúa al héroe Link en una nueva y encantadora aventura. El juego ofrece una historia nueva, más puzles e incluso un neuvo emdio de transporte. En este juego Link viaja en tren, lo que ofrece nuevas posibilidades de juego. El juego tiene el mismo look que se estableció en el éxito de Nintendo DS.

- Link tiene a un nuevo y valioso compañero. Mientras navega por las distintas mazmorras le acompaña un Fantasma, una grandiosa armadura que responde a sus órdenes. Los jugadores podrán tocar al Fantasma para tomar el control sobre él, y después dibujar una línea en la pantalla táctil para dirigirle a un punto en concreto. El Fantasma puede caminar a través del fuego o la lava, puede usarse como plataforma para cargar con Link cuando hay peligro o incluso interferir para no permitir que el protagonista reciba daño.

- Cuando Link conduce el tren, los jugadores disfrutarán de una satisfactoria combinación de acción y puzles en tiempo real, debiendo solucionarlos para determinar qué camino seguirá la máquina y cómo controlar la velocidad de la mejor manera. Cuando está a borde del tren, Link debe encontrar la mejor ruta hasta el final. Mientras está en ruta, Link disparará cañonazos a los enemigos que le ataquen, o puede hacer sonar la bocina para asustarlos.